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用作有机物料腐熟剂。

有机废弃物在高温条件下通过微生物的生长代谢作用使不稳定的有机物矿质化、腐殖化和无害化进而变成腐熟肥料的过程被称为“堆肥”。为了加快和---堆肥腐熟进程和，通常在堆肥过程中添加有机物料腐熟剂。枯草芽孢杆菌作为一种的有机物料腐熟剂，被广泛用于有机废弃物处理。

液固两相发酵指的是先通过液态发酵，快速培养大量高活力菌体，然后通过无菌输送将高活力菌体接种到固态培养基进行发酵。该方法的优点为结合了液体发酵周期短、菌量大和固态发酵成本低、菌体活力高的优势，同时也回避了液态发酵后期处理复杂的问题。缺点为从液态到固态，菌体可能会因为培养基差异过大导致延滞期过长，进而降低发酵效率。